使用configure命令組態構建。 它定義了系統的各個方面，包括允許使用nginx進行連線處理的方法。 最後它建立一個Makefile。 configure命令支援以下引數：
--prefix = path - 定義將保留伺服器檔案的目錄。 這個同一個目錄也將用於由configure(除了庫源的路徑)和nginx.conf組態檔案中設定的所有相關路徑。 它預設設定為/usr/local/nginx目錄。
--sbin-path = path - 設定nginx可執行檔案的名稱。此名稱僅在安裝期間使用。預設情況下檔案名為 prefix/sbin/nginx。
--conf-path = path - 設定nginx.conf組態檔案的名稱。 如果需要，nginx可以始終使用不同的組態檔案啟動，方法是在命令列引數-c file 指定。 預設情況下，該檔案名為：prefix/conf/nginx.conf。
--pid-path = path - 設定將儲存主進程的進程ID的nginx.pid檔案的名稱。 安裝後，可以使用pid指令在nginx.conf組態檔案中更改檔案名。 預設情況下，檔案名為：prefix/logs/nginx.pid。
--error-log-path = path - 設定主錯誤，警告和診斷檔案的名稱。 安裝後，可以在nginx.conf組態檔案中使用error_log指令更改檔案名。 預設情況下，檔案名為：prefix/logs/error.log。
--http-log-path = path - 設定HTTP伺服器主要請求紀錄檔檔案的名稱。 安裝後，可以使用access_log指令在nginx.conf組態檔案中更改檔案名。 預設情況下，檔案名為：prefix/logs/access.log。
--build = name - 設定一個可選的nginx構建名稱。
--user = name - 設定非特權使用者的名稱，該使用者的憑據將由工作進程使用。 安裝後，可以使用user指令在nginx.conf組態檔案中更改名稱。 預設的使用者名是：nobody。
--group = name - 設定由工作進程使用其憑據的組的名稱。 安裝後，可以使用user指令在nginx.conf組態檔案中更改名稱。 預設情況下，組名稱設定為非特權使用者的名稱。
--with-select_module 和 --without-select_module — 啟用或禁用構建允許伺服器使用select()方法的模組。 如果平台似乎不支援更合適的方法(如kqueue，epoll或/dev/poll)，則會自動構建該模組。
--with-poll_module 和 --without-poll_module — 啟用或禁用構建允許伺服器使用poll()方法的模組。 如果平台似乎不支援更合適的方法(如kqueue，epoll或/dev/poll)，則會自動構建該模組。
--without-http_gzip_module - 禁用構建壓縮HTTP伺服器響應的模組。 需要zlib庫來構建和執行此模組。
--without-http_rewrite_module - 禁用構建一個允許HTTP伺服器重定向請求並更改請求URI的模組。 需要PCRE庫來構建和執行此模組。--without-http_proxy_module - 禁用構建HTTP伺服器代理模組。--with-http_ssl_module - 可以構建一個將HTTPS協定支援新增到HTTP伺服器的模組。 預設情況下不構建此模組。 OpenSSL庫是構建和執行該模組所必需的。--with-pcre = path - 設定PCRE庫源的路徑。庫發行版(4.4 - 8.40版)需要從PCRE站點下載並提取。 其餘的由nginx的./configure和make完成。 該庫是 location 指令和ngx_http_rewrite_module模組中正規表示式支援所必需的。--with-pcre-jit - 使用「即時編譯」支援構建PCRE庫。--with-zlib = path - 設定zlib庫的源路徑。 庫分發(版本1.1.3 - 1.2.11)需要從zlib站點下載並提取。 其餘的由nginx的./configure和make完成。 該庫是ngx_http_gzip_module模組所必需的。
--with-cc-opt = parameters - 設定將新增到CFLAGS變數的其他引數。 在FreeBSD下使用系統PCRE庫時，應指定--with-cc-opt="-I /usr/local/include"。 如果需要增加select()所支援的檔案數，那麼也可以在這裡指定，如：--with-cc-opt="-D FD_SETSIZE=2048"。
--with-ld-opt = parameters - 設定連結過程中使用的其他引數。 當在FreeBSD下使用系統PCRE庫時，應指定--with-ld-opt="-L /usr/local/lib"。
引數使用範例(所有這些都需要在一行中完成)：
./configure
--sbin-path=/usr/local/nginx/nginx
--conf-path=/usr/local/nginx/nginx.conf
--pid-path=/usr/local/nginx/nginx.pid
--with-http_ssl_module
--with-pcre=../pcre-8.40
--with-zlib=../zlib-1.2.11
組態完成後，使用make編譯和安裝nginx。