下面列出了WCF和Web服務之間存在一些重大差異。
屬性：WCF服務是通過定義ServiceContract和OperationContract屬性，而在Web服務，WebService和WebMethod屬性用於定義相同。
協定：WCF支援多種協定，即HTTP，命名管道，TCP和MSMQ；而Web服務僅支援HTTP協定。
託管機制：WCF託管不同的啟用機制，即IIS（Internet資訊服務），WAS（Windows啟用服務），自託管和Windows服務，而Web服務則只能由IIS託管。
服務：WCF支援一個強大的安全，值得信賴的訊息傳遞，事務性和互操作性，而Web服務只支援保障服務。
序列化：WCF支援DataContract序列採用System.Runtime.Serialization，而Web服務通過使用System.Xml.Serialization支援XML序列化。
工具：ServiceMetadata工具（svcutil.exe）用於客戶機生成的WCF服務而WSDL.EXE工具用來產生相同web服務。
例外處理：在WCF中，未處理的異常都是在一個更好的方式通過使用FaultContract處理，並沒有得到Web服務SOAP（簡單物件存取協定）故障返回給用戶端等。
有可能要序列雜湊Tablein WCF，但這不能在web服務中。
係結：WCF支援多種型別，如 basicHttpBinding，WSDualHttpBinding，WSHttpBinding等系結，而Web服務僅支援SOAP或XML。
多執行緒：WCF支援多執行緒利用ServiceBehavIor類，而這Web服務不支援。
雙工服務操作：WCF支援雙工服務業務除了支援單向和請求 - 響應服務操作，而Web服務不支援雙工服務操作。